O CDVDH de Açailândia é organizado da seguinte forma:

1º Assembléia Geral: O órgão máximo de deliberação composto pelos sócios do CDVDH, que decide quais são as prioridades de atuação.

2º Conselho Diretor:Três sócios do CDVDH eleitos em Assembléia Geral por um período de dois anos, responsáveis pelo cumprimento do estatuto da entidade e das deliberações da Assembléia. Delegam através de mandato, poderes para a Secretaria Executiva para atuar, visando o cumprimento dos objetivos do mesmo.

3º Conselho Fiscal: Eleita pela Assembléia, é o encarregado de acompanhar a Secretaria Executiva no tocante a captação de recursos e controle dos gastos.

4º Equipe de Militância: Composta por um Secretario(a) Executivo(a), um Secretário(a) Administrativo(a) e seis responsáveis de área, que coordenam todas as equipes e pessoal contratado e voluntários que realizam as ações propostas.